Дезинфекция-бұл жұқпалы және жұқпалы емес аурулардың қоздырғыштарын жою жөніндегі шаралар кешені. Профилактикалық мақсатта, сондай-ақ жануарлар ауруларының ошақтары пайда болған жағдайларда жүргізіледі. Мәжбүрлі дезинфекция кезінде ағымдағы және қорытынды дезинфекция жүргізіледі.

Үй-жайларда жануарлар мен құстар болмаған кезде дезинфекциялау препараттарын пайдалана отырып дезинфекциялау жүргізіледі. Мал шаруашылығы үй-жайларын дезинфекциялау алдында дезинфекциялауға жататын барлық беттерді механикалық тазалау жүргізіледі, Қоректендіргіштер, ішетіндер, көңді шығару арналары Судан босатылады, ғимараттар (үй-жайлар) артық ылғалды беттерден шығару үшін желдетіледі және кептіріледі.

Жиынтық алаңды айқындау кезінде мал шаруашылығы үй-жайлары жабдықтарының барлық элементтерінің немесе дезинфекциялық ерітінділермен ылғалдандыруға жататын басқа да объектілердің еденінің, қабырғаларының, төбелерінің, қалқаларының, сыртқы және ішкі беттерінің ауданы ескеріледі.

Дезинфекциялық ерітінділерді қолданғаннан кейін объект үш сағатқа жабылады, мүмкіндігінше экспозиция алтыдан он екі сағатқа дейін артады.

Дезинфекция аяқталғаннан кейін зат препараттың иісі толығымен жойылғанша желдетіледі. Дезинфекция сапасын анықтау мақсатында ветеринариялық зертханаларда зерттеулер жүргізіледі. Мұндай зертханалық зерттеулердің нәтижелері қосымша дезинфекция жүргізуге негіз болып табылады.